Bahrain secara umumnya kepulauan yan rata dan bergurun, mengandungi dataran padang pasir yang rendah. Kawasan tertinggi di Bahrain ialah Jabal ad-Dukhan, berketinggina 122 meter. Bahrain menikmati musim sejuk yang singkat dan menghadapi musim panas yang hangat.
Sumber asli Bahrain termasuklah kuantiti minyak mentah dan gas yang besar, di samping bekalan ikan yang mencukupi. Gurun meliputi 92% daripada keseluruhan kawasan lain di Bahrain. Musim panas yang melampau dan ribut pasir adalah bencana alam utama untuk penduduk Bahrain.
Isu-isu alam sekitar yang melanda Bahrain ialah kemusnahan padang pasir dan pesisir pantai kerana kekurangannya tanah (kemusnahan kepada pantai, terumbu karang, dan tumbuhan laut). Pengeroken tanah mengakibatkan pencemaran berikutan tumpahan minyak.
{{Navbox | name = Topik Asia | title = Geografi Asia | titlestyle = | state = autocollapse | border = | navbar = | image = | groupstyle = | liststyle = | listclass = hlist
| group1 = Negara berdaulat | list1 =