| Pos | Pasukan | P | M | S | K | JG | GB | PG | Mt | Promosi, kelayakan atau diturunkan |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Negeri Sembilan | 20 | 12 | 5 | 3 | 33 | 16 | +17 | 41 | Promosi ke Liga Super dan Piala Malaysia |
| 2 | Sarawak United | 20 | 11 | 5 | 4 | 37 | 14 | +23 | 38 | |
| 3 | Terengganu II[a] | 20 | 9 | 8 | 3 | 37 | 18 | +19 | 35 | |
| 4 | Johor Darul Ta'zim II[b] | 20 | 9 | 7 | 4 | 38 | 20 | +18 | 34 | |
| 5 | Kuching City | 20 | 7 | 6 | 7 | 22 | 22 | 0 | 27 | Layak ke Piala Malaysia |
| 6 | Kelantan | 20 | 8 | 3 | 9 | 23 | 28 | −5 | 27 | |
| 7 | Kelantan United | 20 | 8 | 2 | 10 | 25 | 28 | −3 | 26 | |
| 8 | PDRM | 20 | 7 | 5 | 8 | 22 | 25 | −3 | 26 | |
| 9 | Selangor II[c] | 20 | 5 | 9 | 6 | 27 | 26 | +1 | 24 | |
| 10 | Perak II[d] | 20 | 4 | 5 | 11 | 14 | 37 | −23 | 17 | Penyingkiran ke Liga M3 |
| 11 | Skuad Projek FAM-MSN[e] | 20 | 1 | 3 | 16 | 12 | 56 | −44 | 6 | Skuad pembangunan liga |
- ^ Terengganu II tidak akan dinaikkan pangkat dari Liga Premier ke Liga Super. Sekiranya kelab utama, Terengganu diturunkan ke Liga Premier, maka Terengganu II akan turun ke Liga M3.
- ^ Johor Darul Ta'zim II tidak akan dinaikkan pangkat dari Liga Premier ke Liga Super. Sekiranya kelab utama, Johor Darul Ta'zim diturunkan ke Liga Premier, maka Johor Darul Ta'zim II akan turun ke Liga M3.
- ^ Selangor II tidak akan dinaikkan pangkat dari Liga Premier ke Liga Super. Sekiranya kelab utama, Selangor diturunkan ke Liga Premier, maka Selangor II akan turun ke Liga M3.
- ^ Perak II tidak akan dinaikkan pangkat dari Liga Premier ke Liga Super. Sekiranya kelab utama, Perak diturunkan ke Liga Premier, maka Perak II akan turun ke Liga M3.
- ^ Skuad Projek FAM-MSN tidak akan beraksi dalam Liga Super, Piala FA dan juga Piala Malaysia jika layak ke Liga Super secara merit atau mendapat tiket beraksi di Piala Malaysia. Ia kekal sebagai skuad pembangunan dalam Liga Premier[1].
