Virus RNA ialah virus yang memiliki RNA (asid ribonukleik) sebagai bahan genetiknya.[1] Asid nukleik ini biasanya bebenang tunggal RNA (ssRNA) tetapi mungkin juga RNA bebenang ganda dua (dsRNA).[2] Penyakit manusia yang disebabkan oleh virus RNA diantaranya ialah penyakit virus Ebola, SARS, anjing gila, selesema, influenza, hepatitis C, hepatitis E, polio, campak, dan koronavirus.
Jawatan Antarabangsa mengenai Taksonomi Virus (ICTV) mengklasifikasikan virus RNA sebagai Kumpulan III, Kumpulan IV atau Kumpulan V pada sistem Klasifikasi Baltimore mengenai virus dan tidak menganggap virus dengan perantara DNA dalam kitaran hidupnya sebagai virus RNA.[3] Virus yang menggunakan RNA sebagai bahan genetik dan juga sebagai zat perantara DNA dalam kitaran replikasi disebut retrovirus, terdiri dari Kumpulan VI dari pengelasan Baltimore. Virus yang tergolong dalam kategori retrovirus seperti HIV-1 dan HIV-2, penyebab penyakit AIDS.
Istilah lain untuk virus RNA yang secara eksplisit mengecualikan retrovirus ialah ribovirus.[4]
Ciri-ciri
Virus RNA bebenang tunggal dan deria RNA
Virus RNA dapat dikelaskan lebih lanjut mengikut rasa atau kekutuban RNA mereka menjadi virus RNA negatif dan positif, atau virus RNA ambideria. RNA virus deria-positif mirip dengan mRNA dan dengan demikian dapat diterjemahkan dengan mudah oleh sel inang. RNA virus deria negatif melengkapkan mRNA dan dengan itu mesti ditukar menjadi RNA deria positif oleh RNA polimerase yang bergantung pada RNA sebelum diterjemahkan. Oleh itu, RNA yang disucikan dari virus positif dapat secara langsung menyebabkan jangkitan walaupun mungkin kurang berjangkit daripada keseluruhan zarah virus. RNA yang disucikan dari virus deria negatif tidak disebarkan sendiri kerana perlu ditranskripsikan menjadi RNA deria positif; setiap virion dapat ditranskripsikan menjadi beberapa RNA deria positif. Virus RNA ambideria menyerupai virus RNA deria negatif, kecuali mereka juga menerjemahkan gen dari helai negatif.[5]
Virus RNA bebenang ganda
Virus RNA bebenang ganda dua mewakili pelbagai kumpulan virus berbilang dalam sel inang (manusia, haiwan, tumbuhan, kulat, dan bakteria), nombor segmen genom (satu hingga dua belas), dan organisasi virion. Anggota kumpulan ini termasuk rotavirus, yang terkenal secara global sebagai penyebab paling umum gastroenteritis pada kanak-kanak, dan picobirnavirus, yang terkenal di seluruh dunia sebagai virus yang paling umum muncul dalam sampel najis dari baik manusia mahupun haiwan dengan atau tanpa tanda-tanda cirit-birit. Virus lidah biru ialah patogen yang secara ekonomi penting bagi lembu dan biri-biri. Dalam beberapa tahun terakhir, kemajuan luar biasa telah dibuat dalam menentukan, pada tahap atom dan subnanometer, struktur sejumlah protein virus utama dan kapsit virion dari beberapa virus dsRNA, menyoroti selari yang signifikan dalam struktur dan proses replikasi dari banyak virus-virus ini.[2]
Tahap mutasi
Virus RNA pada umumnya memiliki tahap mutasi yang tinggi dibandingkan dengan virus DNA,[6] kerana polimerase RNA virus tidak memiliki kemampuan pembacaan bukti dari DNA polimerase.[7] Ini ialah salah satu alasan mengapa sukar untuk membuat vaksin yang berkesan untuk mencegah penyakit disebabkan oleh virus RNA.[8] Retrovirus juga memiliki tahap mutasi yang tinggi walaupun perantara DNA mereka berintegrasi ke dalam genom inang (dan dengan demikian tunduk pada DNA pembacaan bukti perumah setelah diintegrasikan), kerana kesalahan sepanjang transkripsi terbalik tertanam ke dalam kedua bebenang DNA sebelum integrasi.[9] Beberapa gen virus RNA penting untuk kitaran replikasi virus dan mutasi tidak dapat ditoleransi. Misalnya, kawasan genom virus hepatitis C yang mengekodkan protein teras sangat dilindungi,[10] kerana mengandungi struktur RNA yang terlibat dalam tempat entri ribosom dalaman.[11]
Rujukan
- ^ MeSH, retrieved on 12 April 2008.
- ^ "Listing in Taxonomic Order – Index to ICTV Species Lists". Dicapai pada 11 April 2008.
- ^ Drake JW, Holland JJ (November 1999). "Mutation rates among RNA viruses". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96 (24): 13910–13. Bibcode:1999PNAS...9613910D. doi:10.1073/pnas.96.24.13910. PMC 24164. PMID 10570172.
- ^ Nguyen M, Haenni AL (2003). "Expression strategies of ambisense viruses". Virus Res. 93 (2): 141–50. doi:10.1016/S0168-1702(03)00094-7. PMID 12782362.
- ^ Sanjuan, R.; Nebot, M. R.; Chirico, N.; Mansky, L. M.; Belshaw, R. (2010). "Viral Mutation Rates". Journal of Virology. 84 (19): 9733–48. doi:10.1128/JVI.00694-10. ISSN 0022-538X. PMC 2937809. PMID 20660197.
- ^ Klein, Donald W.; Prescott, Lansing M.; Harley, John (1993). Microbiology. Dubuque, Iowa: Wm. C. Brown. ISBN 978-0-697-01372-9.
- ^ Steinhauer DA, Holland JJ (1987). "Rapid evolution of RNA viruses". Annu. Rev. Microbiol. 41: 409–33. doi:10.1146/annurev.mi.41.100187.002205. PMID 3318675.
- ^ Boutwell CL, Rolland MM, Herbeck JT, Mullins JI, Allen TM (Oktober 2010). "Viral Evolution and Escape during Acute HIV-1 Infection". J. Infect. Dis. 202 (Suppl 2): S309–14. doi:10.1086/655653. PMC 2945609. PMID 20846038.
- ^ Bukh J, Purcell RH, Miller RH (Ogos 1994). "Sequence analysis of the core gene of 14 hepatitis C virus genotypes". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91 (17): 8239–43. Bibcode:1994PNAS...91.8239B. doi:10.1073/pnas.91.17.8239. PMC 44581. PMID 8058787.
- ^ Tuplin A, Evans DJ, Simmonds P (Oktober 2004). "Detailed mapping of RNA secondary structures in core and NS5B-encoding region sequences of hepatitis C virus by RNase cleavage and novel bioinformatic prediction methods". J. Gen. Virol. 85 (Pt 10): 3037–47. doi:10.1099/vir.0.80141-0. PMID 15448367.
Pautan luar
- RNA Viruses dalam Tajuk Subjek Perubatan (MeSH) di Perpustakaan Perubatan Negara AS
- Animal viruses