Universiti Stony Brook merupakan salah satu daripada universiti di Long Island, New York, Amerika Syarikat.
Salah seorang kakitangannya, Paul Christian Lauterbur berkongsi Hadian Nobel dalam Perubatan pada tahun 2003 bersama Peter Mansfield untuk hasil kerjanya yang membolehkan pembangunan of imej getaran magnetik "magnetic resonance imaging". Mesin MRI asalnya terletak dalam bangunan Kimia di kampus Universiti Stony Brook di Long Island, New York.